MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018888	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018888	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018888	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018888	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018888	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018888	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018888	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018888	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018888	T	6	6	6017	6022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018888	AG	4	8	6055	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018888	A	7	7	6069	6075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018888	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018888	AGAA	2	8	6122	6129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018888	ACC	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018888	ACC	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018888	ACC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018888	GTAA	2	8	7540	7547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018888	ACC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018888	ATT	2	6	7720	7725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018888	T	6	6	7753	7758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018888	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018888	A	7	7	9891	9897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018888	AAGA	2	8	9908	9915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018888	AGG	2	6	10265	10270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018888	GAG	2	6	11062	11067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018888	T	7	7	11068	11074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018888	AAT	2	6	11079	11084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018888	T	8	8	11118	11125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018888	G	7	7	11710	11716	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018888	CTCC	2	8	12064	12071	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_018888	TTTA	2	8	12072	12079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018888	AAAAG	2	10	12107	12116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018888	A	6	6	12134	12139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018888	TAT	2	6	12178	12183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018888	AT	3	6	12258	12263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018888	GATCG	2	10	12266	12275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018888	CTT	2	6	12280	12285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018888	TTAG	2	8	12293	12300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018888	CAAG	2	8	12365	12372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018888	TGG	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018888	AAG	3	9	12604	12612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018888	AAG	2	6	12618	12623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018888	CTC	2	6	15392	15397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018888	GTA	2	6	15753	15758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018888	AAT	2	6	15771	15776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018888	T	6	6	15783	15788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018888	CT	3	6	15821	15826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018888	T	6	6	15830	15835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018888	T	6	6	15858	15863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018888	A	6	6	15885	15890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018888	TAAAA	2	10	15908	15917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018888	AG	3	6	15999	16004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018888	TAA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018888	ATA	2	6	16140	16145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018888	A	6	6	16163	16168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018888	ATG	2	6	16179	16184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018888	TTG	2	6	16212	16217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018888	TAA	2	6	16249	16254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018888	CAA	2	6	19313	19318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018888	ATT	2	6	19346	19351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018888	T	6	6	19359	19364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018888	T	7	7	19375	19381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018888	TAGAA	2	10	19405	19414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018888	T	6	6	19510	19515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018888	TAA	2	6	19558	19563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018888	ATTT	2	8	20150	20157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018888	GATA	2	8	20189	20196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018888	A	6	6	20255	20260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018888	AT	3	6	20262	20267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018888	A	6	6	20313	20318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018888	TA	3	6	20328	20333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018888	TTA	2	6	20367	20372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018888	AGG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018888	CAA	2	6	22898	22903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018888	ACA	2	6	22917	22922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018888	CCT	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018888	TCA	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018888	A	6	6	27230	27235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018888	T	6	6	29955	29960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018888	ATT	2	6	29963	29968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018888	GTTG	2	8	30129	30136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018888	TC	3	6	30138	30143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018888	ATCG	2	8	30237	30244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018888	GGTTGT	2	12	30273	30284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018888	GAT	2	6	30371	30376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018888	TGC	2	6	30406	30411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018888	ATA	2	6	30445	30450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018888	TA	3	6	30754	30759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018888	ATGTAA	2	12	31057	31068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018888	ACATAT	2	12	31093	31104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018888	TAAT	2	8	31115	31122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018888	AT	3	6	31121	31126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018888	AGG	2	6	31133	31138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018888	AGA	2	6	32539	32544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018888	T	7	7	33204	33210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018888	AAT	2	6	33217	33222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018888	GTT	2	6	33257	33262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018888	ATG	2	6	33264	33269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018888	AGG	2	6	33307	33312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018888	TGA	2	6	34708	34713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018888	GA	3	6	35505	35510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018888	CT	3	6	36691	36696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018888	ATATT	2	10	36738	36747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018888	GTG	2	6	36839	36844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018888	ATA	2	6	36889	36894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018888	TTA	2	6	36895	36900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018888	TAA	2	6	36973	36978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018888	TTCT	2	8	36993	37000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018888	AAG	2	6	37040	37045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018888	AT	4	8	37048	37055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018888	TA	4	8	37059	37066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018888	TA	3	6	37132	37137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018888	AGG	2	6	37166	37171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018888	TAA	2	6	39831	39836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018888	T	7	7	39872	39878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018888	CGA	2	6	39883	39888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018888	GTA	2	6	40607	40612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018888	CGG	2	6	40740	40745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018888	AGTCA	2	10	40754	40763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018888	AGC	2	6	40800	40805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018888	TAAA	2	8	40819	40826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018888	CTA	2	6	40847	40852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018888	TAT	2	6	40865	40870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018888	GCT	2	6	41231	41236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018888	CTT	2	6	41483	41488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018888	T	6	6	41523	41528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018888	CAC	2	6	41548	41553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018888	TTAAA	2	10	41573	41582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018888	ATT	2	6	41708	41713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018888	ATAA	2	8	43968	43975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018888	TA	3	6	43979	43984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018888	T	6	6	44026	44031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018888	AAG	2	6	44114	44119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018888	A	8	8	44164	44171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018888	GTT	2	6	44176	44181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018888	T	6	6	45575	45580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018888	TTTC	2	8	45617	45624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018888	T	6	6	45625	45630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018888	A	7	7	45639	45645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018888	AAAT	2	8	45669	45676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018888	TA	3	6	45690	45695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018888	TGA	2	6	45707	45712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018888	TAT	2	6	46491	46496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018888	CTGA	2	8	46500	46507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018888	T	6	6	46530	46535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018888	TAA	2	6	46549	46554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018888	ATT	2	6	46572	46577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018888	TA	3	6	46595	46600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018888	GTTT	2	8	46621	46628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018888	TTG	2	6	46662	46667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018888	GAG	2	6	46668	46673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018888	A	6	6	49697	49702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018888	TA	3	6	49720	49725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018888	ATT	2	6	49727	49732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018888	GTA	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018888	AATT	2	8	49763	49770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018888	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018888	A	7	7	49821	49827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018888	TA	4	8	49882	49889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_018888	A	6	6	50014	50019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.